A két konstrukció közötti legfontosabb különbség a kamatozásban gyökerezik. Míg az Otthon Start egységesen fix 3 százalékos kamatot biztosított az új és a használt lakásokra is, az új Wekerle Plusz kétlépcsős rendszert vezet be. Az új építésű ingatlanoknál megmarad a 3 százalékos kamat, a használt lakások esetében azonban a támogatott kamatmérték 5 százalékra módosul. Ez a megkülönböztetés érezhetően átrendezheti a keresletet, és a használt lakások drágább hitelezése miatt elmozdíthatja a vevőket az új építésű ingatlanok irányába. Róder Miklós ingatlanpiaci szakértő úgy fogalmazott, hogy az új programmal két legyet akarnak ütni egy csapásra, hiszen a lakhatási célok támogatása mellett az építőipar bebikázását is célozzák a döntéssel.