Káoszt okozna a magyar kormánypártok szerint, ha az uniós ügyészség nyomozna a korrupciógyanús ügyekben. Az igazságügyi minisztériumban pedig úgy értékelik, hogy az új szervezet korlátozná a tagállami hatásköröket. 20 tagállam azonban másként látja, ezért részt vesznek a közös európai ügyészség létrehozásában. A DK szerint a magyar kormány így akarja kivonni magát a független vizsgálatok alól.